Étiologie de la pneumonie acquise dans la communauté chez les enfants d’âge scolaire hospitalisés: Preuve d’une prévalence élevée d’infections virales

Contexte La pneumonie acquise dans la communauté chez les jeunes enfants est le plus souvent associée à des infections virales; Méthodologie Soixante-quinze enfants d’âge scolaire hospitalisés avec CAP ont été évalués prospectivement pour la présence de pathogènes viraux et bactériens Les lavages nasopharyngés ont été examinés par réaction en chaîne de la polymérase pour des virus et des bactéries atypiques Des dosages d’anticorps pour détecter des agents pathogènes bactériens dans des échantillons de sérum en phase aiguë et en phase de convalescence ont également été effectués. Résultats Une infection virale a été identifiée dans% des cas. L’ARN de rhinovirus a été détecté dans% de patients; L’infection par un autre virus est survenue en% Le pathogène bactérien le plus commun était Mycoplasma pneumoniae, qui a été diagnostiqué en% des cas. L’ADN de Chlamydia pneumoniae n’a été détecté chez aucun patient; Les résultats des tests sérologiques étaient positifs chez les patients seuls% d’infections mixtes ont été documentées en% de patients, et la majorité étaient une combinaison virale-bactérienneConclusions La prévalence élevée d’infections virales-bactériennes virales et mixtes soutient la notion que la présence d’un virus, agissant soit en tant que pathogène direct ou indirect, peut être la règle plutôt que l’exception dans le développement de la PAC chez les enfants d’âge scolaire nécessitant une hospitalisation

La pneumonie acquise dans la communauté La PAC est une cause grave de morbidité chez les enfants des pays développés et a un effet considérable sur le système de santé Dans le monde en développement, l’incidence de la pneumonie est plus élevée et cette infection est l’une des principales causes de décès. Des informations détaillées sur l’étiologie de la PAC sont nécessaires pour la formulation de recommandations thérapeutiques et l’introduction de mesures préventives. L’évaluation des infections mixtes et l’importance relative de chaque pathogène potentiel peuvent également contribuer à une meilleure compréhension de l’étiopathogénie de cette infection. , l’identification de la cause d’une infection des voies respiratoires inférieures reste un défi pour plusieurs raisons: des échantillons adéquats sont difficiles à obtenir, et la différenciation entre infection et colonisation ne peut pas toujours être faite De plus, les différents agents responsables méthodologies pour leur détection Comme plus de diagnostic tests, ou des combinaisons d’entre eux sont effectuées, le nombre de causes potentielles directement ou indirectement associées à la pneumonie augmente Streptococcus pneumoniae a été identifié comme la cause la plus importante de pneumonie bactérienne chez les enfants Mycoplasma pneumoniae et Chlamydia pneumoniae sont les causes les plus fréquentes chez les enfants d’âge scolaire , bien que des études récentes aient suggéré leur importance dans les groupes d’âge plus jeunes Les virus, avec prédominance du VRS du virus respiratoire syncytial, ont été le plus souvent associés à la pneumonie chez les nourrissons et les jeunes enfants. Dans de récentes études utilisant de nouvelles méthodologies sensibles, de nombreux virus ont été réadaptés. Ceci est particulièrement vrai pour le rhinovirus humain RV, considéré depuis de nombreuses années comme pathogène des voies respiratoires supérieures antihistaminique h1. Néanmoins, le développement de aidé à identifier le VR comme étant significativement associé aux maladies des voies respiratoires inférieures, Comme l’asthme , la bronchiolite et la PAC Nous avons mené une étude prospective de plusieurs mois sur des enfants d’âge scolaire hospitalisés avec CAP pour étudier de manière approfondie le rôle des virus et des bactéries atypiques et communes au moyen de plusieurs techniques de détection. PCR et tests sérologiques

Patients et méthodes

Un total de patients étaient des garçons âgés de – ans âge médian, mois qui ont été admis consécutivement dans notre département avec le diagnostic de CAP pendant l’année civile ont été inclus dans l’étude Les patients ont été inclus s’ils avaient fièvre température, ⩾ ° C et un infiltrat visible sur une radiographie thoracique Les enfants ayant des troubles sous-jacents chroniques ont été exclus de l’étude. Un questionnaire standard comprenant données démographiques, symptômes cliniques et signes, résultats de laboratoire et radiologiques, traitement, complications et durée d’hospitalisation a été rempli pour chaque patient. Les échantillons ont été conservés congelés à-° C jusqu’à une étude ultérieure. Quarante-cinq patients sont retournés pour un suivi mensuel après la sortie, période au cours de laquelle un échantillon de sérum en phase de convalescence a été prélevé. Obtenu Détection de micro-organismes à base de PCR La présence de matériel génomique des virus et des bactéries atypiques dans le rhinopharynx les échantillons de cendres ont été examinés par extraction d’ARN ou d’ADN, suivie de RT-PCR et PCR directe, respectivement des réactions PCR avec des ensembles d’amorces et des conditions spécifiques pour RSV A et B, des virus influenza A HN et HN et B, des virus parainfluenza, et adenovirus, métapneumovirus humain, et C pneumoniae et M pneumoniae ont été réalisés comme décrit précédemment [, -] Une PCR simple et une PCR séminalisée ont été utilisées pour la détection de RV Des amorces ont été synthétisées à partir de MWG AG Biotech; Les produits de PCR ont été soumis à une électrophorèse sur% de gels d’agarose et les amplicons ont été visualisés par coloration au bromure d’éthidium. Lorsqu’une PCR de type imbriqué ou séminalisé a été utilisée, elle a été réalisée dans une pièce séparée pour éviter l’intrasample. Les anticorps monoclonaux de contrôle du virus et de l’eau ont été inclus dans chaque analyse pour exclure la possibilité de contamination. Tests sérologiques Les anticorps IgG, IgA et IgM contre C pneumoniae ont été mesurés par une micro-immunofluorescence interne méthode au moyen de corps élémentaires purifiés, formalisés, avec la souche K comme antigène, comme décrit ailleurs Le diagnostic repose sur une augmentation du titre entre échantillons sériques appariés ou sur la présence d’IgM dans un échantillon de sérum. Un immunodosage commercial Labsystems Oy a également été utilisé pour la détection d’anticorps IgG et IgM contre C pneumoniae, comme décrit autrement Pour la détection d’anticorps IgM dirigés contre M pneumoniae, on a utilisé l’immunodosage de capture de Platelia Sanofi Diagnostics Pasteur. Pour la détection d’anticorps IgG dirigés contre M pneumoniae, l’EIA de Platelia a été utilisé. Les résultats ont été exprimés positifs ou négatifs. Serion Immunodiagnostica Une augmentation de ⩾ fois du titre d’anticorps a été considérée comme un indicateur d’infection récente dans des échantillons appariés. Anticorps contre S pneumoniae pneumolysine et C-polysaccharide, Haemophilus influenzae , et Moraxella catarrhalis ont été mesurés dans des échantillons sériques appariés par EIA, comme décrit ailleurs Analyse statistique L’association des signes cliniques et des symptômes et des résultats radiographiques et biologiques avec une infection due à différents agents pathogènes a été étudiée. symptômes, signes vitaux, température maximale, auscultation f inductions, présence de rétractions, et saturation en oxygène Ont également été inclus les résultats de radiographie thoracique, tels que le type d’infiltration alvéolaire vs interstitielle, taille segmentale vs lobaire, et la distribution droite vs gauche, et la présence d’atélectasie ou de liquide pleural; des résultats de laboratoire simples, tels que le nombre de leucocytes, le nombre total de neutrophiles, le taux de protéine C-réactive et le taux de sédimentation des érythrocytes; durée de la fièvre après l’admission; durée de l’hospitalisation; Ces caractéristiques incluaient les caractéristiques démographiques, la durée de la fièvre et l’utilisation d’antibiotiques avant l’admission, la présence et la durée de la toux et de la rhinite, et les antécédents d’utilisation de l’asthme et des bronchodilatateurs. Premièrement, des régressions univariées ont été effectuées avec RV seul, mycoplasme seul, S pneumoniae seul, n’importe quel virus, un seul agent pathogène, et une infection mixte pour chaque symptôme. , une analyse multivariée a été effectuée avec toutes les variables qui présentaient un effet statistiquement significatif sur ce symptôme. Le niveau de signification a été fixé à α =% L’analyse statistique a été réalisée avec le logiciel S-Plus MathSoft

Résultats

Infection par ⩾ pathogène L’infection par ⩾ pathogène a été documentée en% des patients. Un ou plusieurs virus ont été détectés chez% des patients, alors que l’infection bactérienne a été documentée dans le% des patients, mais dans le sous-groupe des test sérologique bactérien, l’infection par le micro-organisme was a été identifiée dans% des cas

Tableau View largeDownload slideInfections causées par des virus et des bactéries atypiques diagnostiqués chez les enfants d’âge, – années hospitalisées avec pneumonie acquise en communautéTable Voir grandDownload slideInfections causées par des virus et des bactéries atypiques diagnostiqués chez les enfants d’âge, – années hospitalisées avec pneumonie acquise en communautéVirus infections Dans le tableau ci-dessous, les résultats de la PCR à un tour ont été positifs en% des échantillons. La PCR a permis de détecter des échantillons positifs supplémentaires, ce qui porte à% le nombre total d’enfants infectés par le virus. Chez les patients ayant des échantillons de sérum appariés, l’infection à M pneumoniae a été diagnostiquée en% de PCR et / ou des tests sérologiques. La PCR a été le seul résultat positif au test de dépistage de M pneumoniae. patients, les deux tests ont donné des résultats positifs pour Pour les patients ayant reçu un diagnostic par test sérologique, la présence d’anticorps IgM a été détectée pendant la phase aiguë de la maladie chez les patients% des autres patients, M pneumoniae. l’infection a été diagnostiquée avec l’utilisation de la PCR ou d’un seul examen sérique Dans l’ensemble, les résultats de la PCR réalisée chez tous les patients étaient positifs pour% des patients atteints d’infection à M pneumoniae. Cependant, les résultats de la PCR étaient négatifs dans tous les cas. L’infection à S pneumoniae était détectée en% de patients. Ces patients incluaient un diagnostic uniquement sérologique, une hémoculture positive et des résultats de tests sérologiques, et une hémoculture positive pour laquelle des échantillons de sérum appariés n’étaient pas détectés. disponible Une infection pneumococcique a été diagnostiquée chez% des patients pour lesquels des échantillons sériques appariés étaient disponibles. H influenzae et M catarrhalis n’ont été détectés chez aucun des patients. Infections mixtes ont été documentées chez% des patients L’infection par des agents pathogènes a été découverte chez des enfants et chez des pathogènes. enfants La majorité de ces [%] étaient des infections virales-bactériennes mixtes: des combinaisons monovirus / bactérie unique, un virus double avec une bactérie et une bactérie double avec un virus. Les autres cas étaient des infections à double virus, infection par le virus, et infection à deux bactéries La combinaison la plus fréquente, trouvée dans les cas, était celle de RV et M pneumoniae, comme attendu de leurs hautes fréquences dans l’échantillon Parmi les patients RV-positifs, infection mixte a été trouvée en% de Parmi les infections bactériennes,% de ont été mélangés avec des virusAssociation d’infection due à différents pathogènes avec des résultats cliniques et de laboratoire entre les signes cliniques et les résultats radiologiques et de laboratoire avec infection due à différents agents ont été examinés dans des modèles de régression Aucune association significative n’a été trouvée en ce qui concerne la présence de VR, de virus, de pathogènes ou de S pneumoniae. WBC compte différence moyenne, – cellules / mm; % CI, – à – cellules / mm; P & lt; et une localisation plus fréquente dans l’hémithorax droit OR, % CI, -; P = Cependant, le premier a perdu sa signification après contrôle de la présence de M pneumoniae. L’infection par M pneumoniae était associée à une différence moyenne de température maximale réduite, – ° C; % CI, – ° C à – ° C; P =, nombre de globules blancs (WBC) inférieur, nombre de globules blancs (WBC) pour les personnes infectées par M pneumoniae, cellules / mm; numération leucocytaire moyenne pour les personnes sans infection à M pneumoniae, cellules / mm; différence moyenne, – cellules / mm; % CI, -, à – cellules / mm; P & lt; et un niveau moyen de niveau de protéine C-réactive inférieur pour ceux avec une infection à M pneumoniae, mg / L; niveau moyen pour les personnes sans infection à M pneumoniae, mg / L; différence log-transformée moyenne: – mg / L; % CI, – à – mg / L; P =, tous restants significatifs après contrôle de la présence de virus dans les modèles multivariés

Discussion

ort était M pneumoniae Le taux d’identification% est parmi les plus élevés rapportés, allant de% à ⩾% chez les enfants hospitalisés ou ambulatoires ⩾ ans [-, -] Comme une autre étude récente , la PCR était moins sensible que tests sérologiques pour le diagnostic de cette infection La détection des anticorps IgM pendant la phase aiguë de la maladie peut être un outil utile pour le diagnostic précoce, car ces anticorps étaient présents chez les patients M pneumoniae-positifs. le diagnostic de l’infection à M pneumoniae a été remis en question à cause de la faible spécificité de la réponse IgM Cependant, l’EIA-Platelia à capture μ s’est avéré avoir une excellente spécificité dans le diagnostic de l’infection aiguë à M pneumoniae. infection, l’infection à C pneumoniae était très rarement diagnostiquée chez nos patients, malgré l’utilisation de la PCR et de différentes méthodes de test sérologique. Des cas de CAP ont été rapportés ailleurs chez des patients hospitalisés et ambulatoires [-,], il est probable que C pneumoniae soit rare dans l’enfance PAC dans nos milieux, une constatation en accord avec un précédent rapport de notre région Une forte prévalence des infections avec des bactéries “atypiques” a également été trouvé chez les adultes hospitalisés avec CAP, souvent dans le cadre d’une infection mixte avec des bactéries communes L’importance de l’infection mixte n’est pas claire, bien que plusieurs études chez les adultes ont montré l’avantage d’ajouter un macrolide La prévalence de l’infection par S pneumoniae dans notre étude n’a pu être évaluée que chez les patients pour lesquels des échantillons sériques appariés étaient disponibles, ce qui constitue un point faible de l’étude. Le taux d’infection pneumococcique chez ces patients était faible [%] avec des études antérieures qui ont utilisé des tests sérologiques; le taux de ces études était de% -% chez les enfants âgés de ⩾ ans avec CAP [, -] En outre, la PCR n’a pas été utilisée pour la détection du pneumocoque Un taux élevé d’infections à S pneumoniae a été diagnostiqué dans une étude récente chez les enfants infection des voies avec l’utilisation de la PCR infections mixtes étaient très fréquents%, dont la majorité étaient des infections virales-bactériennes mixtes Ces résultats sont en conformité avec des études récentes suggérant que & gt; Les micro-organismes peuvent souvent contribuer à la pathogenèse de la pneumonie [, -] Le rôle exact de chacun de ces pathogènes reste à clarifier Cependant, il a été spéculé que les virus peuvent induire une pneumonie, directement ou en rendant l’hôte plus sensible aux infections bactériennes. Une prévalence élevée d’infection virale ainsi qu’une infection virale-bactérienne mixte constatée dans notre étude suggèrent que cette possibilité pourrait être la règle plutôt que l’exception dans le développement d’une pneumonie. Il a été montré précédemment que les résultats cliniques, biologiques et radiographiques sont de mauvais indicateurs de un diagnostic étiologique dans la pneumonie infantile C’est également le cas dans notre étude, où la corrélation des symptômes et des constatations avec des infections dues à différents agents n’a révélé que quelques associations, principalement par rapport à M pneumoniae, avec une valeur clinique limitée. Les limites de cette étude doivent être mentionnées Comme dans les rapports précédents [-,,,,,], documentation de l’infection i n les voies respiratoires supérieures ne prouvent pas nécessairement une association étiologique avec la pneumonie Bien que la thoracocentèse puisse fournir des preuves plus solides de la présence locale d’agents pathogènes, il s’agit d’une procédure invasive et comporte certains risques Deuxièmement, variations annuelles de la prévalence Enfin, les résultats rapportés ici ne peuvent pas être extrapolés aux enfants ambulatoires avec CAP. Un travail de laboratoire intensif a été entrepris pour déterminer l’étiologie de la pneumonie dans cette étude. Actuellement, il est peu probable que les résultats du diagnostic viral influencent le traitement. les décisions si elles étaient à la disposition des cliniciens Retenir les antibiotiques ne serait possible que si l’infection bactérienne principalement pneumococcique pourrait être exclue avec certitude L’identification d’une infection virale n’exclut pas la coexistence d’une bactérie, car les infections mixtes sont fréquentes. pneumoniae avec ELISA μ-capture peut En conclusion, l’utilisation de plusieurs dosages, y compris la PCR, peut augmenter la sensibilité dans la documentation de l’infection par différents agents pathogènes en âge d’être scolarisés. les enfants hospitalisés avec des virus CAP sont communément associés à la PAC même dans ce groupe d’âge, avec RV présent chez presque la moitié de ces patients Bien qu’il soit possible qu’une infection virale puisse être un événement pathogénétique initial, voire un prérequis, pour le développement de la pneumonie, des études supplémentaires sont nécessaires pour examiner les aspects épidémiologiques et mécanistiques de cette hypothèse

Remerciements

Soutien financier Compte spécial de recherche de la subvention de l’Université d’Athènes //; à MNT et par le Klosterfrau Award à NGPCflash d’intérêt Tous les auteurs: Pas de conflit