Gènes pour Crohn identifiés

“Le nombre de gènes liés à la maladie de Crohn a été triplé par la recherche qui fournit des cibles prometteuses pour de meilleures thérapies”, a rapporté The Times. Le journal a déclaré que la découverte de 21 nouveaux gènes augmente à 32 le nombre de “passages d’ADN connus pour augmenter la susceptibilité à la maladie”. Le journal a cité un membre important de l’équipe d’étude disant que plus nous comprenons la biologie sous-jacente de ces maladies, mieux nous serons à même de les traiter.

L’étude derrière cette histoire fournit de bonnes preuves qu’il existe un grand nombre de gènes qui peuvent augmenter la susceptibilité d’une personne à la maladie de Crohn. Il convient de souligner que la maladie de Crohn est un trouble complexe et que les facteurs génétiques et environnementaux jouent un rôle. Plus de recherche est nécessaire avant que ces résultats peuvent être appliqués au diagnostic ou au traitement.

D’où vient l’histoire?

Le Dr Jeffrey C. Barrett du Wellcome Trust Centre for Human Genetics de l’Université d’Oxford et plusieurs collègues du Royaume-Uni, d’Europe, du Canada et des États-Unis ont contribué à la recherche. L’étude a été réalisée conjointement par le consortium Wellcome Trust Case Control, le NIDDK IBD Genetics Consortium et le Consortium IBD franco-belge. Il a été financé par le Medical Research Council et le Wellcome Trust. Les contributeurs individuels ont le soutien de diverses sources, y compris les National Institutes of Health, Burroughs Wellcome Foundation et d’autres. L’étude a été publiée dans la revue médicale revue par les pairs Nature Genetics.

Quel genre d’étude scientifique était-ce?

Dans cette publication, les chercheurs ont effectué une méta-analyse de trois études d’association pangénomiques publiées antérieurement, qui ont porté sur des séquences génétiques particulières (variantes) associées à la maladie de Crohn. En regroupant les études, 3 320 personnes atteintes de la maladie de Crohn (les cas) et 4 829 témoins étaient disponibles pour l’analyse.

Les séquences génétiques de ces individus ont été analysées dans le but d’identifier les variations les plus fréquentes chez les personnes atteintes de la maladie de Crohn. En regroupant les études, les chercheurs ont pu identifier des séquences génétiques plus fréquentes chez les personnes atteintes de la maladie de Crohn que les études individuelles n’avaient pas le pouvoir d’identifier. Les variations observées par les chercheurs ont été dispersées à travers la séquence génétique, et ne se trouvent pas toutes dans des gènes ou elles-mêmes modifient la fonction des gènes.

Pour confirmer leurs résultats, les chercheurs ont effectué une analyse supplémentaire dans un échantillon séparé de 2 325 cas de Crohn et de 1 809 témoins et de 1 339 trios de parents et de descendants atteints de la maladie de Crohn. Dans cette analyse, ils ont cherché à voir si les séquences de gènes particulières qu’ils avaient identifiées étaient associées à la maladie de Crohn dans les nouveaux groupes de personnes.

Les chercheurs ont ensuite calculé la contribution des variants au risque de maladie. Ils ont également examiné quels gènes se trouvaient près des variants identifiés, et si leurs variants étaient proches («liés») à toutes les variantes des gènes eux-mêmes, en utilisant une base de données de variants génétiques communs chez l’homme (le HapMap).

Quels ont été les résultats de l’étude?

Les chercheurs ont identifié 526 séquences génétiques distinctes dans 74 régions différentes qui étaient beaucoup plus fréquentes chez les personnes atteintes de la maladie de Crohn. Parmi ces 74 régions, 11 ont déjà été associées à la maladie de Crohn dans d’autres études, de sorte que leur étude portait essentiellement sur l’association avec 63 régions nouvellement identifiées.

Lorsque les chercheurs ont répété leur analyse, ils ont constaté que 21 de ces nouvelles régions étaient significativement associées à la maladie à la fois dans leur population initiale combinée et dans la population de leur étude de réplication. Dans l’ensemble, ils ont estimé que les 21 régions nouvellement identifiées et les 11 régions connues contribuent à environ 10% de la variation du risque de développer la maladie de Crohn. Les 90% restants sont dus à d’autres facteurs génétiques (estimés à 40%) et environnementaux (estimés à 50%).

Quelles interprétations les chercheurs ont-ils tirées de ces résultats?

Les chercheurs concluent que leur étude a identifié des variations dans les 21 régions de la séquence génétique qui sont associées à un risque accru de maladie de Crohn. Cependant, seule une petite variation de risque est expliquée par ces régions, suggérant qu’il existe encore des régions non identifiées associées à la maladie.

Que fait le NHS Knowledge Service de cette étude?

Cette étude bien menée a combiné les résultats d’autres études utilisant des méthodes reconnues dans ce domaine. Les chercheurs soulèvent les points suivants:

Ils disent que la validité de combiner des données provenant de différentes populations de milieux génétiques similaires (dans ce cas, les personnes d’origine européenne) pour étudier l’association entre la variation génétique commune et la maladie doit encore être confirmée. Comme avec toutes les études d’association à l’échelle du génome entier, le pouvoir (c’est-à-dire avoir un échantillon suffisamment grand pour détecter les différences à l’intérieur de celui-ci si elles existent) est un problème important. La combinaison d’échantillons provenant d’études distinctes est un moyen d’augmenter la puissance. Les effets que cette mise en commun aura sur les résultats ne sont pas clairs.

Les chercheurs ont identifié 21 nouvelles régions fortement associées à la maladie de Crohn. Ils concluent que ces régions combinées contribuent à seulement environ 10% de la variance globale du risque de maladie, ce qui démontre à quel point ces troubles peuvent être complexes. Ils concluent également qu’il est «plausible qu’il y ait encore plus [de variantes] à trouver».

Les variantes identifiées dans cette étude peuvent ne pas être les variantes qui augmentent réellement le risque de la maladie de Crohn; ils peuvent simplement se trouver près des variantes «causales». Plus de recherche sera nécessaire pour identifier ces variantes causales.

Une compréhension de la génétique derrière la maladie de Crohn contribuera à une meilleure détection et peut-être un traitement, bien que pour l’instant de telles applications sont loin.

Sir Muir Grey ajoute …

Cela devrait aider à améliorer le traitement médicamenteux.