Le vitiligo «réduit le risque de cancer»

Les personnes atteintes de vitiligo “peuvent avoir une protection naturelle contre le cancer de la peau”, selon BBC News. Cette affection, qui provoque des taches cutanées pâles dues à une perte de pigment, était supposée auparavant augmenter le risque de cancers cutanés graves, tels que le mélanome malin.

L’étude a porté sur 1 514 personnes atteintes de vitiligo et 2 813 personnes sans condition. Les chercheurs ont identifié plusieurs variations génétiques associées à un risque accru de vitiligo. Deux de ces variations étaient également associées à un risque réduit de mélanome, et plusieurs autres étaient localisées dans des régions contenant des gènes connus (ou pensés) pour jouer un rôle dans d’autres conditions immunitaires similaires, comme le diabète de type 1 et la polyarthrite rhumatoïde.

La découverte la plus importante de cette étude a été l’identification des variations génétiques associées au vitiligo. La suggestion d’un lien avec le mélanome incitera sans doute d’autres recherches, mais à ce stade, il est trop tôt pour dire si ces résultats ont des implications majeures pour le risque de mélanome chez les personnes atteintes de vitiligo. Les chercheurs eux-mêmes avertissent que les personnes atteintes de vitiligo doivent toujours faire attention au soleil car elles peuvent rapidement se brûler, et même un risque réduit de mélanome ne signifie pas qu’il n’y a pas de risque.

D’où vient l’histoire?

Cette étude a été réalisée par le Dr Ying Jin et ses collègues du Human Medical Genetics Program de l’école de médecine de l’Université du Colorado, avec des chercheurs internationaux, dont certains étaient basés dans les universités de Sheffield et de Londres. L’étude a été soutenue par des subventions des National Institutes of Health des États-Unis et une subvention de la Fondation Anna et John Sie. L’étude a été publiée dans le New England Journal of Medicine.

Cette recherche a été couverte par BBC News, qui a rapporté à la fois les forces et les limites de l’étude et a correctement mis peu l’accent sur les suggestions que la découverte pourrait conduire rapidement à de nouveaux traitements bronchite chronique.

De quel type de recherche s’aggissait-t-il?

Il s’agissait d’une étude d’association pangénomique dans laquelle les chercheurs cherchaient à identifier les zones du code génétique (appelées loci de susceptibilité) associées au vitiligo généralisé. La condition implique la perte inégale de couleur dans la peau et les cheveux, provoquée par le corps attaquant ses propres cellules productrices de colorant (mélanocytes). Alors que le vitiligo serait partiellement déclenché par des facteurs environnementaux, on sait également que la maladie est partiellement causée par la génétique.

Les chercheurs avaient déjà une idée des sections d’ADN à examiner car des études antérieures avaient suggéré plusieurs locus potentiels. En outre, les patients atteints de vitiligo généralisé ont souvent d’autres maladies auto-immunes, telles que la maladie thyroïdienne auto-immune, la polyarthrite rhumatoïde, le psoriasis et le diabète de type 1 de l’adulte. Cela suggère que ces maladies ont des composantes génétiques communes.

La recherche a impliqué le génotypage. C’est un processus de balayage du code génétique trouvé dans les sections de l’ADN. Dans leur génotypage, les chercheurs ont examiné les variations d’une seule lettre (579,146 variants ou polymorphismes mononucléotidiques [SNP]) sur de vastes zones du code génétique chez 1 514 patients atteints de vitiligo généralisé.

Les résultats de ce génotypage ont été comparés à ceux de 2 813 personnes en bonne santé (groupe témoin). Tous ceux testés étaient d’ascendance blanche européenne. Les résultats ont ensuite été confirmés en les comparant à un deuxième ensemble d’échantillons.

Qu’est-ce que la recherche implique?

Les chercheurs ont prélevé des échantillons d’ADN auprès de 1 514 patients d’Amérique du Nord et du Royaume-Uni qui répondaient aux critères cliniques pour le diagnostic du vitiligo généralisé. Les données génotypiques de ces patients ont été comparées aux séquences génétiques de 2 813 participants de contrôle tirés d’ensembles de données stockés dans une base de données américaine, connue sous le nom de base de données National Institutes of Health Genotype and Phenotype.

Les chercheurs ont évalué à quel point les différents variants (allèles) étaient communs à chacun des 579 146 sites génétiques évalués, cherchant à voir si des variantes étaient plus fréquentes chez les personnes atteintes de vitiligo que chez celles qui n’en possédaient pas. Ils ont également évalué le degré d’association (à quel point la variante était plus commune) et la probabilité que des associations soient apparues par hasard.

Après que les chercheurs aient évalué quels SNP étaient associés au vitiligo, ils ont répété l’analyse en se concentrant sur ces SNP dans deux «ensembles de réplication» indépendants. Ce sont des ensembles d’échantillons différents et sont généralement utilisés dans ce type d’étude pour tester la fiabilité des associations SNP spécifiques trouvées dans la première analyse.

Le premier ensemble de réplication comprenait 677 patients non apparentés atteints de vitiligo généralisé et 1 106 témoins. Le deuxième ensemble de réplication comprenait une cohorte familiale de 183 échantillons provenant de familles où les parents et la progéniture étaient affectés par le vitiligo et 332 échantillons provenant de familles avec deux ou plusieurs membres de la famille affectés et leurs parents non affectés comme témoins. Ces ensembles d’échantillons ont été testés pour la présence de 50 SNP dans neuf régions chromosomiques qui présentaient les associations les plus fortes avec le vitiligo généralisé.

La recherche a été bien décrite et menée. L’utilisation d’ensembles de réplication augmente la fiabilité des résultats. Les procédures de contrôle de la qualité utilisées pour s’assurer que les processus, tels que la purification de l’ADN, sont correctement effectués sont également importantes dans ce type d’étude. Ces procédures ont été décrites en détail dans des documents supplémentaires.

Un consentement éclairé a été obtenu de tous les participants à l’étude.

Quels ont été les résultats de base?

Les chercheurs ont découvert que neuf régions chromosomiques contenaient des SNP associés au vitiligo généralisé. Les niveaux acceptables de signification statistique dans les études d’association pangénomique sont plus élevés que dans d’autres types d’études, ce qui reflète le fait qu’ils peuvent impliquer de nombreux tests statistiques qui peuvent augmenter la probabilité qu’une association soit trouvée par hasard. Toutes les associations dans cette étude ont été rapportées au niveau de signification de p inférieur à 5 × 10-8. Cela signifie qu’il est hautement improbable qu’ils se soient produits par hasard.

Les SNP associés reposent principalement dans des régions précédemment associées à d’autres maladies auto-immunes. Les SNP les plus fortement associés se trouvent dans la région appelée le complexe majeur d’histocompatibilité, qui contient des gènes importants pour le système immunitaire. Les autres régions précédemment associées à d’autres maladies auto-immunes contenaient les gènes PTPN22, LPP, IL2RA, UBASH3A et C1QTNF6. Deux autres régions associées contenaient des gènes supplémentaires liés à l’immunité, appelés RERE et GZMB, et une région associée contenait le gène TYR.

Deux des SNP associés dans la région contenant le gène TYR avaient précédemment été associés à la susceptibilité au mélanome malin. Cependant, les variantes associées à un risque accru de vitiligo étaient également associées à un risque réduit de mélanome malin.

La plupart des 50 SNP testés dans les deux ensembles de réplication ont montré une association significative avec le vitiligo dans au moins l’un des ensembles. Les neuf régions où ces SNP ont été trouvés présentaient les mêmes associations observées dans le premier ensemble d’échantillons.

Comment les chercheurs ont-ils interprété les résultats?

Les chercheurs ont conclu qu’ils avaient identifié des variants génétiques associés au vitiligo généralisé dans de multiples régions chromosomiques, suggérant que plusieurs gènes sont impliqués dans la susceptibilité à cette condition. Ils disent que les gènes dans certaines de ces régions ont été associés à d’autres maladies auto-immunes, et des variantes dans une autre région peuvent être associées à la fois à un risque accru de vitiligo et à un risque réduit de mélanome.

Conclusion

Cette étude est l’une des premières à établir de façon exhaustive des zones de code génétique pouvant être impliquées dans le développement du vitiligo généralisé. Les chercheurs indiquent que leur étude montre peu d’accord avec les associations rapportées dans les études précédentes.

Ils disent que les locus identifiés dans cette étude représentent ensemble environ 7,4% du risque génétique total pour le vitiligo et que, bien que ce soit petit, leur étude est un aperçu important de la maladie.

La suggestion qu’un risque accru de vitiligo s’accompagne d’un risque réduit de mélanome malin est un résultat étonnant de l’étude, mais à ce stade, il est trop tôt pour dire si cela signifie quelque chose. Il faudra de plus amples recherches pour comprendre cette association génétique et comment elle se rapporte au risque de cancer de la peau pour ceux qui ont le vitiligo. Quoi qu’il en soit, tout le monde, y compris les personnes atteintes de vitiligo, devrait éviter de se faire brûler par le soleil.