Syndrome respiratoire aigu sévère Coronavirus sur les surfaces hospitalières

Contexte Nous avons étudié la contribution possible des surfaces contaminées des hôpitaux à la transmission du SRAS en nettoyant les surfaces dans les hôpitaux et en testant les échantillons sur écouvillon par réaction en chaîne de la polymérase par transcriptase inverse RT -RPC et culture viraleRésultats Vingt-six échantillons d’écouvillons testés positifs pour l’ARN viral Échantillons d’écouvillonnage des sécrétions respiratoires de chacun des patients testés positifs par RT-PCR, ainsi que des écouvillons prélevés dans les chambres des patients et d’écouvillons prélevés dans d’autres parties de l’hôpital , y compris les souris dans les postes de soins infirmiers et la rampe du silo public. Les spécimens provenant des zones où les patients sont atteints du SRAS dans les jours de maladie les plus contagieux – étaient plus susceptibles d’être ARN positifs que les échantillons d’écouvillon des échantillons; Bien que les virus identifiés puissent ne pas avoir été infectieux, les agents de santé doivent savoir que le coronavirus du SRAS peut contaminer les surfaces environnementales de l’hôpital et que les vecteurs passifs doivent être considérés comme un mode possible de transmission du SRAS.

Au cours de l’éclosion du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), le pourcentage de cas dans le monde chez les travailleurs de la santé variait de% aux États-Unis à% au Canada On croyait que la transmission se faisait principalement par contact direct avec des personnes malades ou propagation de gouttelettes Plusieurs groupes d’infection bien décrits étaient difficiles à expliquer par ces routes, y compris la transmission à des personnes à bord d’un avion , à des invités partageant le même étage d’un hôtel , et à & gt; En outre, de nombreux agents de santé ont été infectés même après la généralisation de recommandations sur les précautions à prendre pour protéger les barrières, la disponibilité d’équipements de protection individuelle et l’application apparente des directives de l’Organisation mondiale de la Santé en matière de contrôle des infections. ,,] Ces observations ont conduit certains à spéculer sur le rôle possible de la transmission plus éloignée, y compris la diffusion aéroportée par de petites gouttelettes ou de véritables aérosols et la propagation du fomite après contact avec des surfaces environnementales contaminées par le coronavirus du SRAS. la propagation a parfois été impliquée dans la transmission hospitalière d’autres virus, tels que le rotavirus, et de bactéries, comme Enterobacter cloacae Il existe des preuves expérimentales que le CoV du SRAS peut survivre plusieurs heures sur une lame de microscope séchée et peut-être plus longtemps dans les selles. , mais dans quelle mesure les surfaces environnementales étaient contaminées La contamination par le CoV du SRAS au cours de l’éclosion réelle n’a pas été décrite

Méthodes

y compris un hall de réception public qui servait de centre de coordination et de transfert du SRAS et le service des urgences où les patients atteints du SRAS étaient évalués et triés. Au moment de l’écouvillonnage, les travailleurs de la santé de l’hôpital B utilisaient un équipement de protection individuelle. et des normes de ventilation et de nettoyage environnemental recommandées par les lignes directrices disponibles ont été établies, mais n’ont pas été appliquées uniformément. Les patients de chacune des chambres ont été infectés par le CoV du SRAS à un moment ou à un autre au cours de leur maladie. par RT-PCR, tests d’anticorps neutralisants, ou les deux Le jour de la maladie pour lequel ces patients ont été confirmés comme infectés par le CoV du SRAS variait du jour, pour le patient dans la chambre au jour, pour le patient dans la chambre. les surfaces ont été tamponnées Au moment de la première ronde d’écouvillonnage en avril, l’hôpital entier avait été contenu pour le jour s, un cordon de policiers avait mis en quarantaine l’hôpital, et un total de cas de SRAS avaient été signalés parmi les travailleurs de la santé. Le climatiseur avait été éteint, les services de blanchisserie et d’enlèvement des ordures n’étaient pas en mesure de fonctionner. avec la fourniture et la distribution d’équipement de protection individuelle Dans cet environnement chaotique, certains travailleurs hospitaliers portaient la même paire de gants pour soigner plusieurs patients, les patients atteints du SRAS étaient transportés dans les ascenseurs principaux pour radiographie et autres procédures, et les membres de la famille étaient mis en quarantaine à l’intérieur de l’hôpital ont continué à fournir des soins personnels pour certains patients avec SARSSurfaces pour l’écouvillonnage ont été sélectionnés séquentiellement, en commençant par les surfaces considérées comme les moins susceptibles d’héberger le virus et de travailler vers ces surfaces plus susceptibles d’être contaminés, afin de minimiser la contamination croisée Les procédures d’écouvillonnage étaient similaires mais pas identiques pour les événements d’échantillonnage. Le personnel qui effectuait l’écouvillonnage portait des vêtements de protection complets, y compris un respirateur N, une capuche chirurgicale, une blouse chirurgicale, une blouse en plastique propre, des couches de couvre-pieds jetables et des ensembles de gants en latex. -contamination des écouvillons Chaque écouvillon stérile a été ouvert séparément et les supports de transport viraux ont été fermés et l’écouvillon usé a été jeté avant de passer à la surface suivante Un nouvel ensemble de gants extérieurs a été utilisé pour chaque nouvel échantillon et les robes extérieures ont été changées Une zone circulaire de ~ cm de diamètre a été tamponnée avec un Dacron stérile ou un applicateur de coton humidifié dans un milieu de transport viral. Les applicateurs ont ensuite été tournés dans un flacon à vis, pressés contre le côté et jetés dans un refroidisseur portatif. sur de la glace humide, enlevé pendant la durée de l’écouvillonnage ~ min, remis dans le refroidisseur, puis remis dans un congélateur à – ° C dans les minutes qui suivent le prélèvement. collectés, étiquetés, emballés et expédiés sur de la glace carbonique dans les jours suivant l’écouvillonnage, conformément aux directives de l’Association du transport aérien international. Des échantillons ont été testés par RT-PCR et culture virale dans des laboratoires distincts. La Thaïlande et les échantillons prélevés en avril à Taïwan ont été testés aux États-Unis au Centre de contrôle et de prévention des maladies (CDC); Atlanta, GA, et les écouvillons obtenus en mai ont été testés au Centers for Disease Control à Taipei, Taiwan, en utilisant des méthodes similaires. En bref, des aliquotes de milieu de transport viral ont été inoculées sur des cellules Vero E et incubées pendant des semaines, avec un examen cytopathogène. La RT-PCR en temps réel a été réalisée avec des ensembles d’amorces / sondes complémentaires aux cibles indépendantes du génome du CoV du SRAS. Chaque essai comprenait un contrôle positif et des contrôles d’eau négatifs pour les phases d’extraction et d’amplification de l’ARN. Résultats positifs pour ⩾ des cibles RT-PCR Pour évaluer la présence d’inhibiteurs de RT-PCR dans les échantillons, tous les échantillons ont également été testés en utilisant un ensemble amorce / sonde complémentaire de l’ARN ribosomal inclus dans le mélange réactionnel. des échantillons testés positifs pour le CoV du SRAS ont été effectués dans un laboratoire indépendant utilisant différents ensembles d’amorces / sondes, et tous les échantillons ayant donné des résultats positifs à la RT-PCR ont été retestés à partir de nouveaux extraits d’une aliquote précédemment non ouverte de l’échantillon original. Les produits de PCR ont été séquencés et comparés avec la séquence de la souche de CoV SRAS cultivée en laboratoire. L’analyse était principalement descriptive. Nous avons défini les zones avec les patients les plus infectieux. zones, y compris les chambres d’hôpital ou les postes de soins infirmiers associés, où il y avait des patients avec une infection confirmée par le CoV du SRAS qui avaient été malades pendant des jours χ des tests ont été utilisés pour comparer les proportions et une valeur P de & lt; a été considéré comme significatif

Résultats

L’un des prélèvements de l’hôpital A de Bangkok a été testé positif au SRAS, ainsi que les prélèvements effectués à l’hôpital B de Taipei en avril et les prélèvements effectués à l’hôpital B de Taipei en mai. Des prélèvements de sécrétions respiratoires ont été cet exercice, et chaque patient avait ⩾ échantillon d’écouvillon avec un résultat de test positif, y compris des échantillons sur écouvillon de tubes endotrachéaux de patients vivants et un écouvillon prélevé sur le rhinopharynx d’une personne décédée & lt; h après la mort Les échantillons d’écouvillon avec des résultats positifs ont été obtenus à partir de% des surfaces dans les chambres des patients, mais ont également été obtenus à partir de% des surfaces ailleurs dans l’hôpital.

Table View largeDownload slideRésultats de la RT-PCR d’échantillons prélevés dans l’hôpital A en Thaïlande après le décès d’un patient souffrant d’un syndrome respiratoire aigu sévère SARSTable View largeDownload slideRésultats de la RT-PCR sur des échantillons d’écouvillons prélevés dans l’environnement A en Thaïlande dans h après le décès d’un patient atteint du syndrome respiratoire aigu sévère SRAS

Tableau View largeDownload slideRésultats de la RT-PCR des écouvillons environnementaux obtenus en mai à l’hôpital B de Taiwan dans lesquels de nombreux patients atteints du syndrome respiratoire aigu sévère étaient traitésTable Voir grandDownload slideRésultats de la RT-PCR des écouvillons prélevés en mai sur l’hôpital B à Taiwan, où de nombreux patients atteints du SRAS sévère étaient traités Le génome viral a été détecté dans des échantillons prélevés dans des zones où des patients étaient dans la phase la plus infectieuse du SRAS, notamment les chambres des patients, les postes de soins infirmiers et le service des urgences. En revanche, seuls des échantillons des zones publiques de l’hôpital B et de l’hôpital A en Thaïlande ont été testés positifs. P = Les patients atteints du SRAS n’étaient présents que transitoirement dans les espaces publics de l’hôpital B et les échantillons du patient en Thaïlande ont été obtenus le jour après le début de la fièvre. Tous les écouvillons avaient des cultures qui ne présentaient pas de croissance. f Le séquençage des produits PCR de Taïwan a indiqué que ces souches étaient génétiquement distinctes de la souche de CoV du SRAS couramment utilisée dans le laboratoire CDC aux États-Unis. Tous les témoins négatifs pour l’eau et l’écouvillon avaient des résultats de RT-PCR négatifs et tous les échantillons ARN ribosomique, indiquant que les résultats faussement négatifs causés par l’inhibition de la RT-PCR étaient peu probables

Discussion

Le risque de contamination des surfaces par le virus du SRAS doit être souligné dans les directives pour les pratiques de lavage des mains et pour l’enlèvement et l’élimination en toute sécurité des équipements de protection individuelle en quittant les zones potentiellement contaminées par le CoV du SRAS. Le contrôle et la surveillance des pratiques de lutte contre l’infection devraient faire partie des stratégies de prévention du SRAS . En outre, la possibilité de contamination de l’environnement à la suite de procédures de réanimation d’urgence et d’autres événements où les pratiques de contrôle de l’infection n’ont pas été suivies doit être L’étendue de la contamination de surface entre les hôpitaux de Taiwan et de Thaïlande mérite d’être prise en considération Les surfaces de l’hôpital de Taiwan ont été nettoyées à un moment chaotique L’hôpital venait d’être mis en quarantaine et la plupart des services auxiliaires et de soutien ne fonctionnaient pas; Il est rassurant qu’aucune surface ne soit testée positive à l’hôpital en Thaïlande, ce qui implique peut-être que, dans un contexte non hotique, l’attention portée aux procédures de quarantaine standard minimise la contamination de surface epilepsie : les différentes formes chez l’enfant. Il est toutefois possible que certaines différences de taux de positivité de la PCR soient dues à des facteurs spécifiques au patient et non à des différences dans les pratiques de contrôle des infections. Les surfaces traitées à l’hôpital thaïlandais étaient situées dans une zone où seul le CoV du SRAS – patient positif, décédé le lendemain de l’apparition de la maladie, à un moment où la charge virale devrait être faible En revanche, les surfaces traitées à l’hôpital de Taiwan étaient situées dans des zones où un certain nombre de patients infectés par le La durée de la maladie entre les jours et les jours où l’excrétion virale devrait atteindre son apogée a fait l’objet d’un traitement si la contamination des surfaces hospitalières était En outre, si les virus étaient parfois infectieux, ces résultats pourraient aider à expliquer pourquoi les travailleurs de la santé ont continué à être infectés longtemps après que les recommandations de barrières strictes et de précautions aéroportées étaient disponibles [,,] Il est important de distinguer entre Dans les premiers jours après la reconnaissance de l’épidémie dans l’hôpital de Taiwan, le SRAS et les directives générales de contrôle des infections n’étaient pas systématiquement appliquées et si l’équipement de protection, les contrôles environnementaux et une hygiène appropriée des mains avaient été appliqués de manière cohérente. , il est probable que tout impact d’une éventuelle contamination environnementale aurait été minimisé. Nous insistons sur le fait qu’aucun des spécimens n’était positif pour la culture, indiquant que ce que nous avons identifié était un génome viral non infectieux dans la plupart des cas. aussi possible qu’il y avait des virus viables sur les surfaces, mais qu’il Les autres chercheurs ont démontré que le CoV du SRAS peut survivre séché sur des lames de microscope pendant plusieurs heures et que le virus viable peut être cultivé même après plusieurs jours de traitement. milieu humide ou stable, comme dans les échantillons de selles Bien que le nombre de surfaces contaminées à l’extérieur des zones associées aux patients atteints du SRAS soit faible, nous avons détecté des virus dans les silos publics et il semble y avoir plus de contamination des surfaces. Les comparaisons de la proportion d’écouvillons testés positifs pour le CoV du SRAS doivent être interprétés avec prudence, car le choix du type et du nombre de surfaces à échantillonner a été fait de façon non systématique et dans un environnement chaotique et est donc ouvert à une variété de biais potentiels. Néanmoins, les visiteurs et le personnel Dans les hôpitaux, les patients atteints du SRAS doivent être conscients de la possibilité de présence du virus en dehors des chambres de ces patients, malgré les efforts déployés pour contenir la propagation. Le dogme actuel indique que le SRAS est transmis principalement par contact direct avec des personnes malades et par grosses gouttelettes. En effet, une bonne partie de l’épidémiologie de l’épidémie de SRAS peut être bien expliquée par ces modes de transmission La transmission par des moyens plus éloignés, comme les voies aériennes ou les vecteurs contaminés, a été postulée comme une explication des grappes inhabituelles. , comme la transmission à bord d’un avion , à l’étage d’un hôtel ou dans un complexe d’appartements La contamination des surfaces environnementales pourrait jouer un rôle plus important que d’habitude dans la transmission et les schémas épidémiologiques , si regroupés dans les zones de soins aux patients avec un niveau élevé de trafic, comme nous l’avons trouvé ici, peut être difficile à distinguer des modèles prédictifs par propagation de personne à personne ou par grandes gouttelettes

Remerciements

Nous reconnaissons avec gratitude les contributions de James A Comer, pour la culture virale; King Chwan-Chuen, Ruey Jen-Su, David Wong et James Lando, pour leur aide à la réponse à Taiwan; Soutien financier de nombreux travailleurs de la santé dans les deux hôpitaux pour leur travail malgré la menace réelle pour leur santé et leur vie. Soutien financier L’étude a été menée pendant une éclosion aiguë et n’avait pas de financement spécifique, mais les chercheurs ont été appuyés par le gouvernement. Taïwan et par les États-Unis Centres de contrôle et de prévention des maladiesConflit d’intérêts Tous les auteurs: Pas de conflit